儘管香港研究工作的資助來源頗多，但教資會轄下的研究資助局是為香港的學術研究提供撥款的最主要公共資助機構。
於1999至2000的學術年度內，受教資會資助的院校在研究項目、有關合約、職員薪酬及獎學金方面的研究總開支達44.51億港元，約佔1999年本港生產總值0.36%，較1998至1999年度的40.26億港元開支(約佔生產總值的0.32%)，大幅增加。
1999至2000年度內，受教資會資助的院校從各個途徑獲得資助的新增項目及合約共4,384項，所獲撥款總額約11.75億港元，而上一年度則有4,308項新增項目及合約（資助總額為11.11億港元）。 1999至2000年度新增研究項目的資助總額為16.23億港元。
截至1999至2000年度，研究及合約項目累積至14,214項，總撥款額達49.49億港元，相對於1998至1999年度末的累積項目總數13,304項（總撥款額為43.09億港元），增幅頗大。

受教資會資助院校每年必須向研資局就研究活動 與經常補助金及其他研究撥款的運用，提交工作報告。
每所院校必須向研資局提交以下三份周年報告：
概述本學術年度內院校的研究活動 及工作
詳列各項進展中而並非由研資局角逐撥款資助的研究項目
詳列教學人員在本學術年度內發表的研究報告及成果 有關要點在以下章節中概述。

1999至2000年度新增學術研究項目從各個途徑獲得的直接撥款總額達10.327億港元，1998至1999年度則為9.794億港元。
表2.1羅列新增研究項目的資助來源及其分配比例，詳細數字見附錄A。

進展中研究項目於1999至2000年度的撥款總額為45.493億港元（對比1998至1999年度的總額40.138億港元），其中，約32%的資助來自教資會或研資局以外的來源。
表2.2羅列1999至2000年度進展中研究項目的資助來源及其分配比例，詳細數字請參閱附錄B。
表2.3詳列八所受教資會資助院校進展中的研究項目及合約的資助來源。

本港研究人員於1999至2000年度內發表經審閱及未經審閱的研究作品共22,326份，而1998至1999年度則有20,886份，其中，經審閱的由上一年度的11,376份增至12,085份。
有關數字請參閱表2.4，詳細數字則載於附錄C。

研資局與其他資助研究的機構經常保持聯繫，互相核對研究經費的申請，以防止不必要的重疊撥款。
研資局經常與下列主要研究資助機構保持聯繫：
裘搓基金會
香港賽馬會
余兆麒醫療基金
優質教育基金
創新科技署
衛生事務研究委員會和健康護理及促進基金委員會
環境及自然保育基金
海外及中國內地的學術研究資助機構（如德國學術交流協進會、中國國家自然科學基金委員會等）